由于其固有的可萃取物含量低，尼龍膜針式過(guò)濾器通常用于過(guò)濾要進(jìn)行HPLC分析的樣品。
尼龍膜針式過(guò)濾器可能并不適用于所有樣品，并且是接近中性pH水溶液和相容的非水溶劑的理想選擇。對(duì)于由酸和堿組成的樣品，可以考慮使用親水性PTFE膜針頭過(guò)濾器和PES膜針頭過(guò)濾器。
對(duì)于由與尼龍不兼容的非水溶劑組成的樣品，可以考慮使用PTFE膜針式過(guò)濾器和聚丙烯膜注射器過(guò)濾器。
對(duì)于含有蛋白質(zhì)或感興趣的類似大有機(jī)分子的水性樣品，注射器過(guò)濾器應(yīng)含有固有蛋白質(zhì)結(jié)合特性低的膜，例如醋酸纖維素（CA），